PLATEFORME D’ANNOTATIONS GÉNOMIQUES DE COHORTES DANS LE CADRE D'ESSAIS CLINIQUES DE PHASE I A III (LAM/SMD/ SYNDROMES DE PRÉDISPOSITIONS AUX LEUCÉMIES)

Développement clinique

LAM
SMD
Syndromes de prédisposition aux leucémies

Thérapie ciblée
Immunothérapie

Recherche clinique (TRL 6-8)

Le Laboratoire d'Hématologie du CHU de Lille apporte son expertise de biologie moléculaire pour l'annotation systématique des échantillons de patients dans le cadre d'essais cliniques.

Le laboratoire a l’expertise dans l’annotation des cohortes des groupes coopérateurs académiques.

Description

Périmètre des activités de recherche

Recherche clinique concernant les pathologies LAM, SMD, ARCH (age-related clonal hematopoiesis) ayant pour objectif l'amélioration du soin et de la qualité de vie des patients :

Recherches cliniques interventionnelles

Rôle

Participation à l'établissement du protocole clinique
Conception des analyses
Organisation, mise en œuvre et conduite des analyses
Interprétation et communication des résultats

Infrastructure

Plateformes expérimentales et d'analyse :

Génomique (séquenceur Novaseq)

Modèles :

Cellules primaires des patients de l'étude clinique

Personnels techniques :

Personnels qualifiés : ingénieurs, techniciens de laboratoire, biologistes moléculaires
Support bioinformatique : Equipe de bioinformatique du plateau commun de biologie moléculaire du Centre de Biologie Pathologie du CHU de Lille (en partenariat)

Spécifications

La plateforme

Plateforme d'analyses génomiques standardisées pour l'annotation des échantillons de patients, dans le cadre d'essais cliniques de phase I à III :

Panel NGS myéloïde complet (100 gènes)

Les études

Analyses génomiques

Identification des variations nucléotidiques et insertions/délétions de l’ADN
Seuil de sensibilité 2% de cellules mutées

Mesure de la maladie résiduelle

Suivi d’un marqueur génétique préalablement identifié
Seuil variable selon technique utilisée (10-4 à 10-6)

Exemples de partenariats

Annotation génomique de la cohorte ALFA-0702 (LAM de l’adulte jeune) - Cette étude visait à identifier les anomalies moléculaires des LAM de l’adulte jeune ainsi que de suivre la maladie résiduelle en cours de traitement afin d’établir un modèle de stratification pronostique basée sur une approche « banque de connaissance ».

Partenaire : Groupe ALFA

Annotation génomique de la cohorte AZA-PLUS (SMD de haut risque) - Cette étude visait à identifier les anomalies moléculaires dans les SMD de haut risque et définir l’impact des différentes thérapies proposées dans les sous-groupes moléculaires.

Partenaire : GFM