ANALYSES MÉTABOLIQUES, GÉNOMIQUES, TRANSCRIPTOMIQUES ET FONCTIONNELLES DE LA NICHE LEUCÉMIQUE POUR LES ESSAIS DE PHASE 1 (NMP/LAL/LAM/SMD)
- Développement clinique
- NMP
- LAL
- LAM
- SMD
- Thérapie ciblée
- Médecine de précision
- Chimiothérapie
- Recherche clinique (TRL 6-8)
Le service d'hématologie biologique du CHRU de Tours (Pr Olivier HERAULT) apporte son expertise des mécanismes liés à la chimiorésistance et ses plateformes d'analyses métaboliques, génomiques, transcriptomiques et fonctionnelles pour les études cliniques de phase I, dans le domaine des leucémies.
Le Service d’Hématologie Biologique assure le développement, la réalisation, l’interprétation et le suivi des examens spécialisés en hématologie cellulaire pour l’ensemble du CHRU de Tours, et plus largement pour la région Centre dans les domaines des hémopathies malignes et des greffes de cellules souches hématopoïétiques.
Description
Périmètre des activités de recherche
Recherche clinique concernant les pathologies LAM, NMP, SMD et LAL ayant pour objectif l'amélioration du soin et de la qualité de vie des patients :
- Recherches interventionnelles : essais cliniques précoces pour de nouvelles approches thérapeutiques
Rôle
- Participation à la rédaction du protocole clinique sur le versant des analyses biologiques
- Conception des analyses
- Organisation, mise en œuvre et conduite des analyses
- Interprétation et communication des résultats
Infrastructure
Plateformes expérimentales et d'analyse :
- Stations de modélisation de l'hypoxie et de la pression intra-médullaire (Avatar®)
- Cytométrie de flux : FACS (BD Melody®)
- Analyses métaboliques en temps réel (Seahorse®, Omnilog®)
- Systèmes d'analyse en single cell (dont Chromium Controller 10X Genomics)
- Systèmes d'analyse en single cell (dont Chromium Controller 10X Genomics)
- Analyses génomiques, transcriptomiques, métabolomiques, lipidomiques
Modèles :
- Cellules primaires des patients de l'étude clinique, avec possibilités de tri FACS au sein de l’entité pour étudier des sous-populations d’intérêt
Personnels techniques :
- 4 ingénieurs PhD
- 3 techniciens
Assurance qualité
Analyses réalisées dans un laboratoire hospitalier accrédité par le COFRAQ. Analyses de grade clinique avec un circuit intra-CHU exclusif (services cliniques, Centre d’Investigation clinique, service d’hématologie biologique).
Spécifications
La plateforme
Analyses métaboliques (energétique / oxydatif) couplées aux analyses génomiques, transcriptomiques et fonctionnelles des acteurs de la niche leucémique (cellules hématopoïétiques, cellules stromales mésenchymateuses) pour les essais de phase I, à partir des cellules primaires des patients (moelle, sang).
Les études
Evaluation de la toxicité du candidat médicament :
- Analyses du cycle cellulaire, de l’apoptose, des cassures de l’ADN
- Analyses du métabolisme oxydatif (quantification des ROS par CMF, antioxydogrammes, voie NRF2, signalisation MAPK) et énergétique (glycolyse, phosphorylation oxydative)
- Analyses transcriptomiques (RNAseq, scRNAseq, RT-qPCR), génomiques (profils mutationnels par NGS) et épigénomiques (méthylation ADN)
- Analyses fonctionnelles (cultures de progéniteurs hématopoïétiques, LTC-IC en dilution limites, différenciation des MSCs)
Modalités
- Projet de recherche clinique à promotion industrielle
- Accord de partenariat avec le promoteur de l'étude